物流信息系統是把各種物流活動與某個-體化過程連接在一起的通道。一體化過程建立在四個功能層次上，即交易系統、管理控制、決策分析及制定戰略計劃。

第一層次是交易系統。它是用于啟動和記錄個別的物流活動的最基本的層次。它包括記錄訂貨的內容、安排存貨任務、作業程序選擇、裝運、定價、開發票，以及接收消費者查詢等。當收到的消費者訂單進入信息系統時，就開始了交易系統的第一步；接著按訂單安排存貨，記錄訂貨內容；然后指導材料管理人員選擇作業程序；指揮搬運.、裝貨及按訂單交貨；最后打印和傳送付款發票完成整個交易過程。交易系統的特征是：格式規則化、通信交互化、交易批量化、作業逐日化。

第二層次是管理控制。在這個層次中要求把主要精力集中在功能衡量和制作報告上。.功能衡量用以提供有關服務水平和資源利用等的反饋信息。普通的功能衡量包括金融,、顧客服務、生產率，以及質量指標等。特殊功能的衡量包括運輸和倉儲成本（成本衡量）、庫存周轉（資產衡量）、供應比率（顧客服務衡量）、每:n時生產量（生產率衡量），以及顧客的感覺（質量衡量）等。管理控制的特征是可估價的、策略上的，是中期的焦點問題。它評價過去的功能和鑒別各種可選方案。

第三層次是決策分析。在這個層次中把主要精力集中|在決策應用上。協助管理人員鑒別、評估、比較物流戰略和策略上的可選方案。，典型的分析包括車輛日常工作和計劃、庫存管理、.設施選址，以及有關作業比較和安排的成本與收益分析。與管理控制層次相同的是，決策分析也以策略上的、可估價的焦點問題為特征。.與管理控制不同的是，決策分析的主要精力集中在評估未來策略上的可選方案，，并且它需要相對松散的結構和靈活性，以便作:范圍很廣的選擇。物流信息系統的決策分析主要強調有效，而不是強調效率（利用.更少的人力資源實現更快的處理和增加交易量）。 '

最后一個層次是制定戰略計劃。在這個層次.中把主要精力集中在信息支持上，以期開發和制定物流戰略。戰略計劃中包括通過戰略聯盟使協作成為可能、廠商的能力和市場機會的開發和提煉以及顧客對改進的服務所作的反應等。這個層次一般是決策分析層次的延伸，但卻更加抽象、松散，而且更加注重長期效應。