特定減免稅是指由國務院或國務院授權的海關總署、財政部根據國家政治、經濟政策的需要，對特定地區、特定用途、特定的資金來源的進出口貨物制定的專項減免稅規定。根據特定減免稅通關制度的規定，減免稅貨物的基本通關程序，按順序由以下4階段組成。

(1)進口前的減免稅申請，即貨物進口前向海關提出申請并取得《進出口貨物征免稅證明》,該證明書的有效期為3個月，情況特殊，經海關批準可以延長，但延長的最長期限為3個月。

(2)進口時憑《征免稅證明》報關，即憑《征免稅證明》及其它報關單證辦理該貨物的報關手續。

(3)使用期間接受監督和核查，即定期或不定期向海關呈報反映減免稅貨物使用情況的報表，以接受海關監督與核查。

(4)海關監管期限屆滿后解除監管。根據規定，特定減免稅貨物自海關放行進口之日起，船舶、飛機和建筑材料滿8年，機動車輛和家用電器滿6年，其它機器滿5年的，原減免稅申請人應當向主管海關申請解除海關對減免稅進口貨物的監管，主管海關經審核批準，簽發《減免稅進口貨物解除監管證明》。