黑龍江省位于中國東北部，是中國位置最北、緯度最高的省份，東西跨14個經度，南北跨10個緯度。北、東部與俄羅斯為界，西部與內蒙古自治區相鄰，南部與吉林省接壤。全省土地總面積47.3萬平方千米（含加格達奇和松嶺區），僅次于新疆、西藏、內蒙古、青海、四川，居全國第六位。

黑龍江水系是全國三大通航水系之一，主要通航河流有黑龍江、松花江、烏蘇里江、嫩江四大干流和第二松花江、額爾古納河、呼蘭河等支流及鏡泊湖、興凱湖等，總通航里程7570千米，溝通中國東北地區9市55個縣（旗）及俄羅斯遠東地區，江海聯運航線可直達曰韓等國及中國東南沿海港口，具有發展水運的良好條件。

黑龍江省內通航里程5528千米，航道維護里程4295千米，其中，三級及以上航道1924千米，四級航道1213千米；中俄界河（黑龍江、烏蘇里江、松阿察河、興凱湖）航道維護里程2385千米。全省航道（航標）建設、管理、維護和測量、勘界等任務主要由黑龍江省航道局及所屬佳木斯、黑河分局承擔，現有挖泥船、航標船、測量艇等各類航道工程船舶175艘。

全省現有碼頭泊位166個（不含自然碼頭泊位），港口經營企業166家，年貨物綜合通過能力1514萬噸，旅客通過能力317萬人。其中，哈爾濱、佳木斯兩港被交通部列為主要港口，黑河、同江是重要外貿港口。自1986年以來，經國務院批準，省內相繼對外開放哈爾濱、佳木斯、黑河、同江、撫遠、漠河、呼瑪、奇克、嘉蔭、名山、饒河、孫吳、富錦、綏濱、悅來等15個港口，是中國內河水運開放口岸數最多的省份，它們是黑龍江省擴大對俄開放、發展外向型經濟的重要窗口。

全省現有各類船舶1466艘，總功率12.6萬千瓦，1.99萬客位，凈載重噸位25.8萬載重噸位，年運輸能力24億噸。全省現有水運企業697家，其中船舶運輸企業531家，修造船企業12家。貨運船舶噸位較大，專業運輸船舶以1000噸、600噸級駁船為主，駁船平均載重量591噸，遠髙于全國內河平均水平；船型標準化程度較高，貨運船舶以推駁船隊為主，分節駁占駁船總量60%左右；客運船舶形成了以水翼艇和氣墊船高速客運為主、普通客船為輔的格局。黑龍江水運擔負著對俄貿易，沿江煤、木、糧、油大宗貨物及江海聯運等任務，在全省經濟發展、支援邊疆建設、擴大對俄開放、運送國際物資等方面一直發揮著不可替代的作用。