有些國家如日本、荷蘭等，沒有設立自由港或自由貿易區，但實行保稅區制度。保稅區(Bonded Area)又稱保稅倉庫區，是海關設置的或經海關批準注冊的、受海關監管的特定地區和倉庫。國外商品存入保稅區內，可以暫時不繳進口稅；如再出口，不繳出口稅；如要進入所在國的國內市場，則要辦理報關手續，交納進口稅。進入保稅區的國外商品，可以進行儲存、分裝、混裝、加工、展覽等。此外，有的保稅區還允許在區內經營保險、金融、旅游、展銷等業務。因此，許多國家對保稅區的規定與自由港、自由貿易區的規定基本相同，保稅區起著類似自由港或自由貿易區的作用。

1990年，經國務院批準，我國借鑒國際通行的做法，按照自由貿易區模式建立了中國第一個保稅區——上海外高橋保稅區，隨后又先后建立了天津港、深圳福田、深圳沙頭角、大連、廣州、江蘇張家港、青島、寧波、福州、廈門、汕頭、?？?、深圳鹽田港和珠海保稅區，使保稅區總數達到了15個。

西方國家在保稅區的倉庫，有的是公營的，有的是私營的；有的貨物的儲存期限為1個月到半年，有的期限可達3年；有的允許進行加工和制造，有的不允許進行加工和制造。

按照職能不同，保稅區一般分為指定保稅區、保稅貨棚、保稅倉庫、保稅工廠、保稅展廳等。

1.指定保稅區

指定保稅區是為了在海港或國際機場簡便、迅速地辦理報關手續，裝卸、搬運和臨時儲存商品的場所。商品在該區內儲存的期限較短、限制較嚴。

2.保稅貨棧

保稅貨棧是指經海關批準用于為外國商品提供裝卸、搬運或暫時儲存進口商品的場所。

3.保稅倉庫

保稅倉庫是經海關批準，外國商品可以連續長時間儲存的場所。保稅倉庫便于貨主把握交易時機出售商品，有利于業務的順利進行和轉口貿易的發展。從經營方式上看，保稅倉庫主要有以下3種：

(1)由有外貿經營權的企業自營的專業性保稅倉庫，一般只儲存本企業經營的保稅貨物，如紡織品進出口公司自營的保稅倉庫，只用于儲存進口的紡織品原料和加工復出口的成品。

(2)公共保稅倉庫。是具有法人資格的經濟實體，可向海關申請建立專營倉儲業務，其本身一般不經營進出口商品，它面向社會和國內外保稅貨物持有者。外運公司經營的保稅倉庫即屬于這一類型。

(3)海關監管倉庫，這也是保稅儲存的一種類型，主要存放貨物以及行李物品進境而所有人未來提取，或者無證到貨、單證不齊、手續不完備以及違反海關章程，海關不予放行，需要暫存海關監管倉庫聽候海關處理的貨物。這種倉庫有的由海關自行管理，也可以交由專營的倉儲企業經營管理，海關行使行政監管職能。

4.保稅工廣

保稅工廠是經海關批準可以對外國商品進行加工、制造、分類以及檢修等業務活動的場所。

5.保稅展廳

保稅展廳是經海關批準，在一定期限內用于陳列外國貨物進行展覽的保稅場所。保稅展廳通常設置在本國政府或外國政府、本國企業或外國企業等直接舉辦或資助舉辦的博覽會、展覽會上，它除了具有保稅的功能外，還可以展覽商品，加強廣告宣傳，促進貿易的發展。

保稅區和保稅倉庫的出現，為國際物流的海關倉儲提供了既經濟又便利的條件。在國際貿易中有時會出現對商品不知最后作何處理的情況，買主(或賣主)可將商品在保稅倉庫暫存一段時間。若商品最終復出口，則無須繳納關稅或其它稅費；若商品將內銷，可將納稅時間推遲到實際內銷時為止。而從物流角度看，應盡量減少儲存時間、儲存數量，加速商品和資金周轉，實現國際物流的高效率運轉。目前，各國為了提高其經濟開放程度，更好地融入國際間的經濟交流，紛紛實行各種經濟特區政策。除了保稅區政策之外，與國際貿易和國際物流相關的經濟特區政策還包括自由貿易港政策和出口加工區政策。