出口加工區的基本政策是按照“境內關外”的思路進行設計的。出口加工區的主要優惠政策體現在稅收和管理兩個方面。

（一）出口加工區實行的稅收優惠政策

為吸引新增加工貿易企業在區內投資，引導現有加工貿易企業進入出口加工區，國家在區內實行特殊的稅收優惠政策，具體體現在對區內貨物實行的免稅、保稅和退稅政策。

（1）免稅政策。①區內企業生產所需進境的機器、設備、模具及其維修用零配件，區內生產性的基礎設施建設項目所需進境的機器、設備和建設生產廠房、倉儲設施所需的基建物資，區內企業、行政管理機構進境自用的辦公用品，除法律、行政法規另有規定外，免征進口關稅、增值稅和消費稅。②區內企業加工的制成品及其在加工生產過程中產生的邊角料、余料、殘次品、廢品等銷往境外時，除法律、行政法規另有規定外，免征出口關稅。③區內加工出口的產品和應稅勞務免征增值稅、消費稅。

（2）保稅政策。區內企業為加工出口產品所需進境的原材料、零部件、元器件、包裝物料及消耗性材料，予以全額保稅。

（3）退稅政策。從境內進入出口加工區，供區內企業使用的國產機器、設備、原材料、零部件、元器件、包裝物料以及加工企業和行政管理部門所需合理數量的辦公用品和建筑材料等，可按有關規定和程序辦理出口退稅手續。

（二）海關對出口加工區的管理便利化

根據設立出口加工區的指導原則，海關在區內實行新的加工貿易監管模式，簡化有關手續，方便企業通關，為企業創造良好的經營環境。

（1）對出口加工區采取全封閉、卡口式管理，海關實行24小時工作制度。

（2）對出口加工區采用計算機管理的模式，海關與區內企業實行計算機聯網管理，企業可采取EDI方式報關。

（3）對區內企業開展的加工貿易業務，不實行加工貿易銀行保證金臺賬制度，取消《登記手冊》，采用電子賬簿進行管理，海關對企業實行每半年一次的總量扣減核銷制度。

（4）對區內與境外之間進、出的貨物，實行"備案制"管理；區內與區外之間進、出的貨物，實行"報關制"管理。

（5）出口加工區與口岸、出口加工區與出口加工區之間進、出的貨物、物品，采取直通式或轉關運輸的監管模式，一律在出口加工區主管海關報關并在卡口查驗、放行。實行"一次報關，一次審單，一次查驗"的新通關模式。

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