集裝箱運輸方式根據貨物裝箱數量和方式分為整箱和拼箱兩種。

（1）整箱（Full Container Load，FCL）。是指貨方將貨物裝滿整箱后，以箱為單位托運的集裝箱。一般做法是由承運人將空箱運到工廠或倉庫后，在海關人員監督下，貨主把貨裝入箱內，加封、鉛封后交承運人并取得站場收據（Dock Receipt），最后憑站場收據換取提單。

（2）拼箱（Less Than Contain Load，LCL）。是指承運人或代理人接受貨主托運的數量不足整箱的小票貨物后，根據貨類性質和目的地進行分類、整理、集中、裝箱、交貨等工作，這些工作均在承運人碼頭集裝箱貨運站（CFS）或內陸集裝箱運轉站進行。

集裝箱的交接方式大致有四類：FCL/FCL、LCL/LCL/LCL/LCL、LCL/FCL，其中以FCL/FCL交接效果最好，也最能發揮集裝箱的優越性。

集裝箱的交接地點，歸納起來可分為四種方式：門到門、門到站場、站場到門、站場到站場。